Show simple item record

Επεξεργασία μεταβολομικών δεδομένων με φασματοσκοπία πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού

dc.contributor.advisorZoumpoulakis, Panagiotis
dc.contributor.authorΚολάκη, Ευμορφία Άννα
dc.date.accessioned2022-08-31T16:25:50Z
dc.date.available2022-08-31T16:25:50Z
dc.date.issued2022-07-19
dc.identifier.urihttps://polynoe.lib.uniwa.gr/xmlui/handle/11400/2814
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.26265/polynoe-2654
dc.description.abstractΗ παρούσα διπλωματική έχει ως σκοπό την εφαρμογή της γλώσσας προγραμματισμού R καθώς και μεθόδων πολυμεταβλητής στατιστικής ανάλυσης σε δεδομένα μεταβολομικής από φασματοσκοπία Πυρηνικού Μαγνητικού Συντονισμού (NMR). Στόχος ήταν η αναζήτηση του βέλτιστου τρόπου επεξεργασίας των φασματικών δεδομένων για την περαιτέρω στατιστική ανάλυση. Συγκεκριμένα χρησιμοποιήθηκε μια βάση φασματοσκοπικών δεδομένων που αναφέρονται στο μεταβολικό αποτύπωμα συγκεκριμένης ποικιλίας ντομάτας καθώς και το ελεύθερα διαθέσιμο λογισμικό NMRProcFlow το οποίο αναλύει και επεξεργάζεται φάσματα NMR χωρίς να είναι αναγκαία η γραφή κώδικα. Για την πολυμεταβλητή στατιστική ανάλυση χρησιμοποιήθηκαν μέθοδοι - όπως η PCA, η PLS-DA και η OPLS-DA. Επίσης, ταυτοποιήθηκαν και ποσοτικοποιήθηκαν οι μεταβολίτες των φασμάτων μέσω εφαρμογής αυτοματοιποιημένου αλγορίθμου. Ακολούθησε συγκριτική στατιστική ανάλυση με χρήση των συγκεντρώσεων των μεταβολιτών.el
dc.format.extent68el
dc.language.isoelel
dc.publisherΠανεπιστήμιο Δυτικής Αττικήςel
dc.rightsΑναφορά Δημιουργού - Μη Εμπορική Χρήση - Παρόμοια Διανομή 4.0 Διεθνές*
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/deed.el*
dc.subjectMεταβολομικήel
dc.subjectΜεταβολίτεςel
dc.subjectΣτατιστική ανάλυσηel
dc.subjectRel
dc.subjectΦασματοσκοπία NMRel
dc.subjectΠολυμεταβλητή στατιστική ανάλυσηel
dc.subjectPCAel
dc.subjectPLS-DAel
dc.subjectOPLS-DAel
dc.titleΕπεξεργασία μεταβολομικών δεδομένων με φασματοσκοπία πυρηνικού μαγνητικού συντονισμούel
dc.title.alternativeProcessing of metabolomic data from nuclear magnetic resonance spectroscopyel
dc.typeΔιπλωματική εργασίαel
dc.contributor.committeeCavouras, Dionisis
dc.contributor.committeeMatsoukas, Minos-Timotheos
dc.contributor.facultyΣχολή Μηχανικώνel
dc.contributor.departmentΤμήμα Μηχανικών Βιοϊατρικήςel
dc.description.abstracttranslatedThe purpose of this thesis is the application of R-programming as well as multivariate statistical analysis on metabolic data derived from Nuclear Magnetic Resonance (NMR) Spectroscopy. The main aim was to find the best way to process the spectral data for further statistical analysis. A spectroscopic data base which is the metabolic fingerprint of a specific species of tomato was used. Also, the freely available software called NMRPRocFLow was utilized which analyzes and processes NMR spectra, without the need to use coding skills. We conducted multivariate statistical analysis by using PCA, PLS-DA and OPL-DA methods. Quantification and identification of metabolites from the NMR spectra of tomatoes has occurred by using a specialized, automated algorithm. Lastly, in order to assess the results, a statistical analysis has been done over the concentration of metabolites.el


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Αναφορά Δημιουργού - Μη Εμπορική Χρήση - Παρόμοια Διανομή 4.0 Διεθνές
Except where otherwise noted, this item's license is described as
Αναφορά Δημιουργού - Μη Εμπορική Χρήση - Παρόμοια Διανομή 4.0 Διεθνές