Ανάλυση μικροβιακού πληθυσμού σε θαλασσινό νερό: Escherichia coli

Abstract

Η θάλασσα είναι συνυφασμένη με τη ζωή του ανθρώπου, αφού αποτελεί για αυτόν μέρος αναψυχής και φιλοξενεί πολυάριθμα ζωικά είδη, εκ των οποίων ορισμένα καταναλώνονται από αυτόν. Ωστόσο η θάλασσα εγκυμονεί αρκετούς κινδύνους, καθώς αποτελεί δεξαμενή ευκαιριακά παθογόνων μικροοργανισμών που μπορεί να οδηγήσουν στην ανάπτυξη λοιμώξεων. Ένα άλλο ζήτημα που έχει προκύψει είναι η ύπαρξη ανθεκτικών στα αντιβιοτικά μικροοργανισμών στο θαλάσσιο οικοσύστημα. Αυτό το φαινόμενο οφείλεται στην αλόγιστη χρήση των αντιβιοτικών σε ποικίλους τομείς, υπολείμματα των οποίων μέσω διάφορων οδών, όπως υδάτινων απορροών, λυμάτων και λοιπών ανθρωπογενών δραστηριοτήτων καταλήγουν σε υδάτινα σώματα συμπεριλαμβανομένων των θαλασσών. Η παρούσα ερευνητική διπλωματική εργασία εξέτασε την παρουσία του βακτηρίου Escherichia coli (E. coli), το οποίο είναι καθιερωμένος δείκτης κοπρανώδους μόλυνσης, σε δείγματα θαλασσινού νερού. Ακόμα μελέτησε την αντιμικροβιακή αντοχή και τις φυλογενετικές ομάδες των απομονωθέντων στελεχών. Η έρευνα πραγματοποιήθηκε σε πολυπληθή κολυμβητικής ακτή του Πειραιά κατά τη διάρκεια δύο δειγματοληψιών της κολυμβητικής περιόδου, τον Μάιο και τον Ιούλιο του 2023. Βάσει των αποτελεσμάτων η συγκεκριμένη κολυμβητική ακτή δεν συνίσταται για κολύμβηση, καθώς σε κάθε δειγματοληψία καταμετρήθηκαν >500cfu/100ml. Συνολικά, απομονώθηκαν 107 στελέχη (66 από την πρώτη και 41 από τη δεύτερη δειγματοληψία), εκ των οποίων τα 87 ταυτοποιήθηκαν ως E. coli και μελετήθηκαν περαιτέρω. Η ανάλυση της αντιμικροβιακής αντοχής έδειξε ότι τα περισσότερα στελέχη ήταν ευαίσθητα σε όλα τα υπό μελέτη αντιβιοτικά (53%, 46/87). Επίσης αρκετά συχνή ήταν η ανίχνευση ανθεκτικών στελεχών (47%, 41/87) αλλά κανένα δεν εμφάνισε πολυανθεκτικότητα. Επιπλέον, σύμφωνα με τα αποτελέσματα της φυλογενετικής τυποποίησης, η πλειοψηφία των στελεχών κατατάχθηκε στην ομάδα Β2 (34%, 30/87) και ακολούθησαν οι ομάδες Β1 (31%, 27/87), Α (29%, 25/87) και D (6%, 5/87). Ακόμα, η ομάδα Β2 ήταν η πιο συχνή μεταξύ των ανθεκτικών πληθυσμών ενώ η Β1 μεταξύ των ευαίσθητων. Παρά το γεγονός ότι το πλήθος των ανθεκτικών στελεχών που ανευρέθηκαν ήταν μικρός αριθμός, τα ευρήματα υπογραμμίζουν την ανάγκη για συνεχή παρακολούθηση της ποιότητας του θαλασσινού νερού και της αντιμικροβιακής αντοχής σε αυτά τα ενδιαιτήματα, καθώς και την ανάπτυξη στρατηγικών για τον περιορισμό της διασποράς ανθεκτικών βακτηρίων.