Εμφάνιση απλής εγγραφής

Απομόνωση και γενετικός χαρακτηρισμός βακτηρίων του γένους Vibrio

dc.contributor.advisorΒογιατζάκη, Χρυσάνθη
dc.contributor.authorΡούσσος, Αντώνιος
dc.date.accessioned2024-05-01T06:00:49Z
dc.date.issued2024-03
dc.identifier.urihttps://polynoe.lib.uniwa.gr/xmlui/handle/11400/6674
dc.identifier.urihttp://dx.doi.org/10.26265/polynoe-6510
dc.description.abstractΗ συστηματική μελέτη της θαλάσσιας μικροβιολογίας, ιδιαίτερα υπό το πρίσμα της κλιματικής αλλαγής στις μέρες μας, έχει πολύ υψηλό βαθμός σημαντικότητας. Το γένος Vibrio αφορά ραβδόμορφα, Gram αρνητικά βακτήρια, ενώ απαριθμεί υψηλό αριθμό ειδών, εμφανίζοντας υψηλή γενετική πλαστικότητα και προσαρμοστικότητα σε διαφορετικές κλιματολογικές συνθήκες. Η κλιματική αλλαγή φαίνεται ότι θα επηρεάσει θετικά και σημαντικά τους πληθυσμούς των βακτηρίων Vibrio. Τα είδη του γένους Vibrio εμφανίζουν μικρές γονιδιωματικές διαφορές, με αποτέλεσμα η συστηματική τους μελέτη και οι τεχνολογίες αλληλούχησης νέας γενιάς, να αλλάζουν συχνά την ταξινόμηση πολλών ειδών, ή να δημιουργούνται νέα είδη. Για αυτό το λόγο δεν υπάρχει και ένας ενιαίος τρόπος διάκρισης των ειδών, αλλά χρησιμοποιούνται συνδυαστικά διαφορετικές και πολλαπλές γονιδιωματικές τοπολογίες ανάμεσα στα διαφορετικά είδη. Μέσα σε αυτό το πλαίσιο, στην παρούσα πτυχιακή εργασία συλλέχθηκαν 10 διαφορετικά δείγματα από θαλάσσιες περιοχές του Ελλαδικού χώρου. Χρησιμοποιώντας εκλεκτικό υπόστρωμα, απομονώθηκαν συνολικά 59 αποικίες που πιθανώς ανήκαν στο γένος Vibrio. Από αυτές, φαινοτυπικά επιλέχτηκαν 35 για γενετικό χαρακτηρισμό γένους, όπου φάνηκε ότι οι 30 ανήκουν στο γένος Vibrio με υψηλό βαθμό εμπιστοσύνης. Στη συνέχεια με ειδοεξειδικευμένους εκκινητές υπό πλατφόρμα RT-QPCR ελέγχθηκαν για αν πρόκειται για τα είδη Vibrio alginolyticus, V. anguillarum, V. harveyi, V. parahaemolyticus και V.splendidus, τα οποία αποτελούν σημαντικά παθογόνα ζώων της θάλασσας και δυνητικά παθογόνα σε ανθρώπους. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι πιθανώς σημαντικό ποσοστό από αυτά ανήκουν στο είδος V.alginolyticus και μικρό ποσοστό αυτών πιθανώς ανήκουν στο είδος V.harveyi, ενώ κανένα από αυτά δε φαίνεται να ανήκει στα είδη V.anguillarum και V.parahaemolyticus. Αναφορικά με το είδος V.splendidus, ορισμένα στελέχη φαίνεται ότι υπάρχει πιθανότητα να ανήκουν σε αυτό, όμως δίνουν θετικό αποτέλεσμα και για άλλα συγγενικά είδη. Μελλοντικά θα πραγματοποιηθούν αναλύσεις ολόκληρου του γονιδιώματος των συγκεκριμένων βακτηρίων, δίνοντάς μας υψηλού βαθμού εμπιστοσύνης αποτελέσματα για την ταξινόμησή τους αλλά και πληροφορίες που αφορούν τη λοιμογονικότητά τους ή/και τα γονίδια αντοχής τους σε αντιβιοτικά.el
dc.format.extent98el
dc.language.isoelel
dc.publisherΠανεπιστήμιο Δυτικής Αττικήςel
dc.rightsΑναφορά Δημιουργού - Μη Εμπορική Χρήση - Παρόμοια Διανομή 4.0 Διεθνές*
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/deed.el*
dc.subjectΠεριβάλλονel
dc.subjectVibrioel
dc.subjectΜοριακή ταυτοποίησηel
dc.titleΑπομόνωση και γενετικός χαρακτηρισμός βακτηρίων του γένους Vibrioel
dc.title.alternativeIsolation and genetic characterization of Vibrio genus bacteriael
dc.typeΠτυχιακή εργασίαel
dc.contributor.committeeΒογιατζάκη, Χρυσάνθη
dc.contributor.committeeSkliros, Dimitrios
dc.contributor.committeeBeloukas, Apostolos
dc.contributor.facultyΣχολή Επιστημών Υγείας & Πρόνοιαςel
dc.contributor.departmentΤμήμα Βιοϊατρικών Επιστημώνel
dc.description.abstracttranslatedSystematic research in the field of marine microbiology has a rather high degree of significance, especially in the light of climate change nowadays. Vibrio genus refers to gram – negative, rod – shaped bacteria and includes numerous species, showing high genomic plasticity and adaptability to different climatic conditions. Climate change appears likely to positively and significantly affect Vibrio populations. Vibrio species show little genomic differences and, as a result, their systematic study and next – generation sequencing technologies often change the classification of many species, or create new ones. Hence, there is no single way of distinguishing the species, but different and multiple genomic topologies are used, combined, among different species. Within this context, in this thesis, 10 different samples were collected from coastal areas of Greece. Using a selective medium, a total of 59 colonies, possibly belonging to the Vibrio genus, were isolated. Among these, 35 were phenotypically selected for genetic characterization (to see in which genus they belong to) and 30 of them were shown to belong to the Vibrio genus with high confidence. Then, with species – specialized primers, using an RT-QPCR platform, they were tested to see whether they belong to any of the species Vibrio alginolyticus, V. anguillarum, V. harveyi, V. parahaemolyticus and V.splendidus which are important pathogens of marine animals and potentially human pathogens. The results showed that probably a significant percentage of them belongs to the species V. alginolyticus and a small percentage of them probably belongs to the species V.harveyi, while none of them seems to belong to the species V.anguillarum and V.parahaemolyticus. As for V.splendidus, some strains could possibly belong to this particular species, but they show positive results for other closely related species as well. In the future, whole genome analyses of these bacteria will be performed, providing us with high - confidence results regarding their classification but also with information regarding their virulence and/or their antibiotic resistance genes.el
dcterms.embargoTerms12 monthsel
dcterms.embargoLiftDate2025-05-01T06:00:49Z


Αρχεία σε αυτό το τεκμήριο

Thumbnail
Thumbnail

Αυτό το τεκμήριο εμφανίζεται στις ακόλουθες συλλογές

Εμφάνιση απλής εγγραφής

Αναφορά Δημιουργού - Μη Εμπορική Χρήση - Παρόμοια Διανομή 4.0 Διεθνές
Εκτός από όπου επισημαίνεται κάτι διαφορετικό, το τεκμήριο διανέμεται με την ακόλουθη άδεια:
Αναφορά Δημιουργού - Μη Εμπορική Χρήση - Παρόμοια Διανομή 4.0 Διεθνές