Αποτελέσματα Εργαστηριακής Επιτήρησης Shigella boydii στην Ελλάδα

Γουάτσον, Δήμητρα Ευαγγελία

Results of Laboratory Surveillance of Shigella boydii in Greece

Μεταπτυχιακή διπλωματική εργασία

Author

Γουάτσον, Δήμητρα Ευαγγελία

Date

2024-09-26

Advisor

Mandilara, Georgia

Μεταπτυχιακή Διπλωματική Εργασία (3.688Mb)

Keywords

Shigella spp. ; S. boydii ; Greece ; Pathogenics bacterium ; Waterborne infections ; Public health ; Παθογόνα μικρόβια ; Υδατογενείς λοιμώξεις ; Τροφιμογενείς λοιμώξεις ; Εργαστηριακή επιτήρηση

Abstract

Εισαγωγή: H Shigella spp. αποτελεί ένα gram αρνητικό παθογόνο βακτήριο, υπεύθυνο για πρόκληση τροφιμογενών και υδατογενών λοιμώξεων στον άνθρωπο. Παράγοντες όπως η μικρή μολυσματική του δόση, η συνεχώς αυξανόμενη αντοχή του σε αντιβιοτικά που χρησιμοποιούνται στις θεραπείες, καθώς και οι λοιμογόνοι μηχανισμοί που διαθέτει είναι που καθιστούν το μικρόβιο αυτό ένα σοβαρό πρόβλημα για τη Δημόσια Υγεία. Ενώ η S.boydii ενδημεί στις χώρες της Νοτιοανατολικής Ασίας, όπως η Ινδία και το Μπαγκλαντές, έχουν καταγραφεί κρούσματα και στην Ελλάδα. Σκοπός: Σκοπός της εργασίας αυτής είναι να παρουσιάσει τα αποτελέσματα της εργαστηριακής μελέτης των κλινικών καλλιεργημάτων S.boydii που απομονώθηκαν στην Ελλάδα την περίοδο 2013-2022. Μεθοδολογία: Συνολικά μελετήθηκαν 27 καλλιεργήματα Shigella boydii, τα οποία είχαν σταλεί στο Εθνικό Κέντρο Αναφοράς Σαλμονελών-Σιγκελών την περίοδο 2013-2022. Ελέγχθηκε η αντοχή τους σε 16 αντιβιοτικά (AST), εφαρμόστηκε η μέθοδος Double Disk Synergy Test-DDST σε καλλιεργήματα τα οποία παρουσίασαν αντοχή σε κεφαλοσπορίνες 3ης γενιάς. Σε ό,τι αφορά την μοριακή τυποποίηση των καλλιεργημάτων, επιλέχθηκε η μέθοδος PFGE, χρησιμοποιώντας ως περιοριστικά ένζυμα τα XbaΙ και NotΙ. Αποτελέσματα: Το 41% των κρουσμάτων αφορούσε παιδιά ηλικίας 0-5 ετών, ενώ το 59% ήταν άνδρες. Τα κρούσματα προήλθαν από έξι διαφορετικές περιφέρειες της Ελλάδας (οκτώ νομοί). Το 77% των δειγμάτων εμφάνισε αντοχή στην Τριμεθοπρίμη, ενώ τα δύο ESBL στελέχη εμφάνισαν αντοχή σε περισσότερο από τρεις ομάδες αντιβιοτικών. Η PFGE έδειξε ένα κυρίαρχο προφίλ, με τα δύο ESBL δείγματα να έχουν σημαντικές διαφορές. Συμπεράσματα: Το βακτήριο S.boydii χρήζει συνεχούς επιδημιολογικής και εργαστηριακής επιτήρηση από τους φορείς Δημόσιας Υγείας στην Ελλάδα. Έτσι, θα μπορούν να λαμβάνονται έγκαιρα τα απαραίτητα μέτρα για την διασφάλιση της υγείας σε ατομικό αλλά και συλλογικό επίπεδο.

Abstract

Introduction Shigella spp. is a Gram-negative pathogenic bacterium responsible for foodborne and waterborne infections in humans. Factors such as its low infectious dose, the continuously increasing antibiotic resistance of the isolates, and its virulence mechanisms make this microorganism a significant public health concern. While S. boydii is endemic in Southeast Asian countries like India and Bangladesh, cases have also been reported in Greece. Objective The aim of this study was to present the results of the laboratory analysis of clinical cultures of S. boydii isolated in Greece during the period 2013-2022. Methodology A total of 27 Shigella boydii cultures, sent to the National Salmonella-Shigella Reference Center between 2013 and 2022, were studied. Antibiotic susceptibility testing (AST) was performed on 16 antibiotics, and the Double Disk Synergy Test (DDST) was applied to isolates showing resistance to third-generation cephalosporins. For molecular typing, Pulsed-Field Gel Electrophoresis (PFGE) was selected using XbaI and NotI restriction enzymes. Results Forty-one percent of cases involved children aged 0-5 years, while 59% were males. Cases originated from six different regions of Greece (eight prefectures). Seventy-seven percent of the samples exhibited resistance to trimethoprim, while the two ESBL strains showed resistance to more than three antibiotic groups. PFGE revealed a predominant profile, with the two ESBL strains showing significant differences. Conclusions S. boydii requires continuous epidemiological and laboratory surveillance by public health authorities in Greece. This will allow for the timely implementation of necessary measures to ensure both individual and public health.