Συγκριτική γονιδιωματική ανάλυση βακτηριοφάγων που μολύνουν το βακτήριο Escherichia coli

Καστανιώτη, Ιωάννα

dc.contributor.advisor	Skliros, Dimitrios
dc.contributor.author	Καστανιώτη, Ιωάννα
dc.date.accessioned	2025-03-12T08:02:20Z
dc.date.available	2025-03-12T08:02:20Z
dc.date.issued	2025-02-17
dc.identifier.uri	https://polynoe.lib.uniwa.gr/xmlui/handle/11400/8689
dc.description.abstract	Τα τελευταία χρόνια, η αντοχή των βακτηρίων στα αντιβιοτικά έχει εξελιχθεί σε μείζον πρόβλημα δημόσιας υγείας, προκαλώντας ανησυχία στην επιστημονική κοινότητα και εντείνοντας την ανάγκη για εναλλακτικές θεραπευτικές προσεγγίσεις. Η εκτεταμένη χρήση και κατάχρηση των αντιβιοτικών έχει οδηγήσει στην εμφάνιση πολυανθεκτικών βακτηριακών στελεχών, καθιστώντας αναποτελεσματικές πολλές κλασικές θεραπείες. Μία από τις πιο υποσχόμενες εναλλακτικές προσεγγίσεις είναι η φαγοθεραπεία, η οποία βασίζεται στη χρήση βακτηριοφάγων, ιών που μολύνουν και καταστρέφουν επιλεκτικά τα βακτήρια. Οι φάγοι μπορούν να χρησιμοποιηθούν μεμονωμένα ή σε συνδυασμούς, γνωστούς ως φαγικά κοκτέιλ, ώστε να αυξηθεί η αποτελεσματικότητά τους και να μειωθεί η πιθανότητα ανάπτυξης ανθεκτικών βακτηρίων. Η μελέτη της γενετικής ποικιλίας και της αλληλεπίδρασης των βακτηριοφάγων με τους ξενιστές τους είναι ζωτικής σημασίας για τη βελτιστοποίηση της φαγοθεραπείας και την ασφαλή εφαρμογή της στη θεραπεία λοιμώξεων. Στην παρούσα ερευνητική εργασία, με τη βοήθεια εξειδικευμένων βιοπληροφορικών εργαλείων, πραγματοποιήθηκε συγκριτική γονιδιωματική ανάλυση, δύο λυτικών βακτηριοφάγων που μολύνουν το βακτήριο Escherichia coli, με σκοπό την αποσαφήνιση των γονιδιωμάτων τους και την ταξινόμησή τους στο φυλογενετικό δέντρο των ιών. Οι φάγοι παρουσίασαν σημαντικές γενετικές διαφορές και κατατάχθηκαν μακριά ο ένας από τον άλλον στο φυλογενετικό δέντρο. Αναλύθηκαν και χαρακτηρίστηκαν τα ανοιχτά αναγνωστικά πλαίσια και εντοπίστηκαν γονίδια ενδιαφέροντος. Οι βακτηριοφάγοι εμφάνισαν υψηλή λυτική ικανότητα. Υπολογίστηκε με την χρήση εξειδικευμένων βιοπληροφορικών εργαλείων η ομολογία τους, σε σχέση με επιλεγμένους Ε .coli φάγους και τα αποτελέσματα συγκρίθηκαν με πληροφορίες που αντλήσαμε από κατοχυρωμένες βάσεις δεδομένων. Η μελέτη αυτή παρέχει νέες πληροφορίες για τη γονιδιωματική βάση των φάγων και τη δυναμική τους στην αντιμετώπιση βακτηρίων. Ταυτόχρονα, ανοίγει τον δρόμο για τη δημιουργία ετερογενών φαγικών κοκτέιλ και για τη περαιτέρω μελέτη συνδυαστικών θεραπειών βακτηριοφάγων-αντιβιοτικών, με στόχο τη βελτίωση της θεραπευτικής αποτελεσματικότητας και της ασφάλειας χρήσης τους.	el
dc.format.extent	84	el
dc.language.iso	el	el
dc.publisher	Πανεπιστήμιο Δυτικής Αττικής	el
dc.rights	Αναφορά Δημιουργού - Μη Εμπορική Χρήση - Παρόμοια Διανομή 4.0 Διεθνές	*
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/deed.el	*
dc.subject	Βακτηριοφάγοι	el
dc.subject	Escherichia coli	el
dc.subject	Φαγοθεραπεία	el
dc.subject	Συγκριτική γονιδιωματική	el
dc.title	Συγκριτική γονιδιωματική ανάλυση βακτηριοφάγων που μολύνουν το βακτήριο Escherichia coli	el
dc.title.alternative	Comparative genomic analysis of bacteriophages infecting Escherichia coli	el
dc.type	Πτυχιακή εργασία	el
dc.contributor.committee	Βογιατζάκη, Χρυσάνθη
dc.contributor.committee	Διολή, Χρυσούλα
dc.contributor.faculty	Σχολή Επιστημών Υγείας & Πρόνοιας	el
dc.contributor.department	Τμήμα Βιοϊατρικών Επιστημών	el
dc.description.abstracttranslated	In recent years, antibiotic resistance in bacteria has become a major public health issue, causing concern in the scientific community and intensifying the need for alternative therapeutic approaches. The widespread use and misuse of antibiotics have led to the emergence of multidrug-resistant bacterial strains, rendering many traditional treatments ineffective. One of the most promising alternative approaches is phage therapy, which is based on the use of bacteriophages, viruses that selectively infect and destroy bacteria. Phages can be used individually or in combinations, known as phage cocktails, to increase their effectiveness and reduce the likelihood of resistant bacteria developing. Studying the genetic diversity and interaction of bacteriophages with their hosts is crucial for optimizing phage therapy and ensuring its safe application in infection treatment. In this study, a comparative genomic analysis was conducted using specialized bioinformatic tools on two lytic bacteriophages that infect Escherichia coli, with the aim of clarifying their genomes and classifying them within the viral phylogenetic tree. The phages showed significant genetic differences and were placed far apart from one another in the phylogenetic tree. Open reading frames were analyzed and characterized, and genes of interest were identified. The bacteriophages exhibited high lytic activity. Using specialized bioinformatics tools, their homology with selected E. coli phages was calculated, and the results were compared with data from established databases. This study provides new insights into the genomic basis of phages and their dynamics in combating bacteria. At the same time, it paves the way for the creation of heterogeneous phage cocktails and further investigation of phage-antibiotic combination therapies, aiming to improve therapeutic efficacy and the safety of their use.	el

Αρχεία σε αυτό το τεκμήριο

Όνομα:: Kastanioti_20678105 (3).pdf
Μέγεθος:: 4.609Mb
Τύπος:: PDF

Προβολή/Άνοιγμα

Αυτό το τεκμήριο εμφανίζεται στις ακόλουθες συλλογές

Πτυχιακές εργασίες
Πτυχιακές εργασίες τμήματος Βιοϊατρικών Επιστημών

Εμφάνιση απλής εγγραφής

Αναφορά Δημιουργού - Μη Εμπορική Χρήση - Παρόμοια Διανομή 4.0 Διεθνές

Εκτός από όπου επισημαίνεται κάτι διαφορετικό, το τεκμήριο διανέμεται με την ακόλουθη άδεια:
Αναφορά Δημιουργού - Μη Εμπορική Χρήση - Παρόμοια Διανομή 4.0 Διεθνές