Η χρήση της μεθόδου CRISPR/Cas9 στη θεραπευτική ανθρωπίνων νόσων
The use of the CRISPR/Cas9 method in the therapeutics of human diseases
Keywords
CRISPR/Cas9 ; CRISPR/Cas9 και βιοηθική ; Γονιδιωματική επεξεργασία ; Προγραμματιζόμενη νουκλεάση ; Θεραπεία μυϊκών δυστροφιών ; Θεραπεία HIV ; Θεραπεία καρκίνουAbstract
Το σύστημα CRISPR/Cas9 αποτελεί την πλέον ανερχόμενη μέθοδο γονιδιωματικής επεξεργασίας, υπερέχοντας των προηγούμενων μεθόδων που περιελάμβαναν άλλες προγραμματισμένες νουκλεάσες. Οι «περίεργες» αυτές αλληλουχίες CRISPR ανακαλύφθηκαν σε βακτήρια και Αρχαία και, όπως διαπιστώθηκε, αποτελούν έναν πλέον καλά χαρακτηρισμένο προσαρμοστικό αμυντικό μηχανισμό ενάντια στους φάγους. Τα δύο βασικά συστατικά της τεχνολογίας CRISPR/Cas9 είναι η πρωτεΐνη Cas9 με τους τομείς ενδονουκλεάσης RuvC και ΗΝΗ, και το RNA-οδηγός μονού κλώνου (sgRNA). Τα δύο αυτά μόρια δρώντας συνεργατικά προκαλούν δίκλωνες θραύσεις στο επιθυμητό τμήμα του DNA που χρήζει επιδιόρθωσης, ενώ οι τομείς ενδονουκλεάσης της Cas9 αφήνουν κομμένα τυφλά άκρα. Τα μονοπάτια HDR ή NHEJ του κυττάρου ενεργοποιούνται στη συνέχεια για την κάλυψη του κενού οδηγώντας σε ποικίλα αποτελέσματα. Για την παράδοση της Cas9 και του sgRNA στα κύτταρα εφαρμόζονται μέθοδοι που χρησιμοποιούν φορείς ιικού ή μη τύπου, με τους δεύτερους να διαχωρίζονται περαιτέρω σε φυσικούς ή χημικούς.
Η διαιώνιση ασθενειών με υπόβαθρο κατάλληλο για γονιδιωματική επεξεργασία μέσω του συστήματος CRISPR/Cas9 προκάλεσε το ενδιαφέρον της επιστημονικής κοινότητας και έτσι διεξήχθησαν προκλινικές μελέτες για τη διερεύνηση της θεραπευτικής προοπτικής της τεχνολογίας αυτής. Στο επίκεντρο των ερευνών τέθηκαν νόσοι όπως ιικές λοιμώξεις, με κυριότερο λοιμογόνο παράγοντα τον ιό ανθρώπινης ανοσοανεπάρκειας HIV, διάφορες μορφές καρκίνου, αιματολογικές διαταραχές, μυϊκές δυστροφίες, καρδιαγγειακές διαταραχές και η κυστική ίνωση, με τα ευρήματά τους ως προς την αποτελεσματική θεραπεία να είναι θετικά. Μάλιστα, ασθένειες κατά τις οποίες όλοι οι νοσούντες φέρουν την ίδια γενετική μετάλλαξη, όπως η δρεπανοκυτταρική αναιμία, αποτελούν ιδανικούς υποψήφιους για θεραπευτική εφαρμογή του συστήματος CRISPR/Cas9. Για την αντιμετώπιση των προαναφερόμενων νόσων στην παρούσα μελέτη προτείνονται ποικίλοι τρόποι δράσης του συστήματος CRISPR/Cas9. Παράλληλα επισημαίνεται ότι, σχεδόν σε όλες τις περιπτώσεις χρειάζεται ιδιαίτερη προσοχή τόσο κατά την επιλογή του τρόπου παράδοσης των συστατικών στοιχείων της τεχνολογίας, όσο και κατά το σχεδιασμό των εκάστοτε RNA-οδηγών ώστε να περιορίζεται η δραστηριότητα εκτός της περιοχής-στόχου.
Abstract
The CRISPR/Cas9 system is the most up-to-date genome editing method surpassing other programmable nucleases. The so-called "weird" CRISPR sequences were discovered in bacteria and Archaea, and are now a well-understood adaptive anti-phage defense mechanism. The two main components of the CRISPR/Cas9 technology are the Cas9 protein with its RuvC and HNH endonuclease domains and the single stranded guide RNA (sgRNA). These two molecules, acting collaboratively, cause double-strand breaks in the desired part of DNA to be repaired, while the Cas9 endonuclease domains leave blunt ends behind. The cell's HDR or NHEJ pathways are then activated to fill the gap, leading to various results. Methods employing viral or non-viral vectors are applied for the delivery of Cas9 and sgRNA to the cells, with the non-viral ones being further classified as physical or chemical.
The perpetuation of diseases being appropriate for genome editing by use of the CRISPR/Cas9 system aroused the interest of the scientific community, and thus preclinical studies to investigate the therapeutic perspective of this technology took place. Research was focused on diseases such as viral infections, where the main infectious agent is the human immunodeficiency virus HIV, various cancer types, hematological disorders, muscular dystrophies, cardiovascular disorders and cystic fibrosis. The results of the research focusing on effective gene editing were promising. Ιn fact, diseases in which patients carry the same genetic mutation, such as sickle cell disease, are considered to be perfect candidates for therapeutic application of the CRISPR/Cas9 system. In the present study, several ways for the CRISPR/Cas9 system to act are proposed regarding the treatment of the aforementioned diseases. Moreover, it is pointed out that in almost all cases much care is needed when choosing the delivery method of the CRISPR components, as well as when designing the respective sgRNAs, so as to reduce possible “off-target” effects.