Αξιολόγηση in vitro μεθόδων ελέγχου ευαισθησίας της Candida auris στα αντιμυκητικά φάρμακα. Προσδιορισμός φυσικού πληθυσμού των διαφορετικών κλάδων Candida auris με μεθόδους αναφοράς και εμπορικά διαθέσιμες δοκιμασίες
Evaluation of different methods for in vitro antifungal susceptibility testing of Candida auris. Determination of wild-type populations of different clades of Candida auris with reference and commercial assays
Λέξεις-κλειδιά
Candida auris ; Μέθοδος αναφοράς μικροαραίωσης σε ζωμό ; Ταινίες διαβαθμισμένης συγκέντρωσης ; Sensititre YeastOne ; Vitek 2 ; Έλεγχος αντιμυκητικής ευαισθησίας ; Ανώτατη οριακή τιμή WTΠερίληψη
Η C. auris είναι ένα αναδυόμενο και συχνά πολυανθεκτικό παθογόνο σε διαφορετικές κατηγορίες αντιμυκητικών, καθιστώντας τον έλεγχο αντιμυκητικής ευαισθησίας ζωτικής σημασίας για τη βελτιστοποίηση των θεραπευτικών αποφάσεων. Επί του παρόντος, δεν έχουν καθοριστεί κλινικά ή επιδημιολογικά όρια ειδικά για το είδος. Ωστόσο, το προφίλ ευαισθησίας της C. auris ποικίλλει σημαντικά ανάλογα με το γεωγραφικό εντοπισμό και συγκεκριμένα τον κλάδο. Οι συγκριτικές αξιολογήσεις, τόσο των πρότυπων μεθοδολογιών μικροαραίωσης ζωμού CLSI και EUCAST, όσο και των ευρέως χρησιμοποιούμενων εμπορικά διαθέσιμων δοκιμασιών, είναι ελάχιστες και βασίζονται σε δεδομένα απόδοσης περιορισμένου αριθμού στελεχών που ανακτήθηκαν από περιορισμένες γεωγραφικές περιοχές. Επομένως, στην παρούσα πτυχιακή αξιολογήθηκαν διαφορετικές μεθοδολογίες
ελέγχου αντιμυκητικής ευαισθησίας, δύο πρότυπες (CLSI και EUCAST) και τρεις εμπορικά διαθέσιμες (Sensititre YeastOne, MIC test strips και Vitek 2) έναντι 100 μοριακά χαρακτηρισμένων κλινικών στελεχών C. auris παγκόσμιας γεωγραφικής κατανομής και από τους πέντε κλάδους, με σκοπό, αφενός τη σύγκριση των ποσοστών συμφωνίας και των κατανομών MIC μεταξύ των μεθόδων και αφετέρου τον προσδιορισμό WT πληθυσμού για την εκάστοτε μέθοδο.
Περίληψη
C. auris is an emerging and frequently multidrug-resistant pathogen to different classes of antifungals, rending antifungal susceptibility testing crucial for optimizing treatment decisions. Currently, species-specific clinical or epidemiological breakpoints
have not yet been established. Nevertheless, C. auris susceptibility patterns can vary significantly with geography and specifically by clade. Head-to-head comparisons of the reference CLSI and EUCAST broth microdilution methodologies and widely used
commercially available assays are limited and rely on testing a limited number of isolates recovered from restricted geographic areas. Therefore, in this thesis, different antifungal susceptibility testing methodologies, two standard (CLSI and EUCAST) and three commercially available (Sensititre YeastOne, MIC test strips and Vitek 2) were evaluated against 100 genetically distinct clinical strains, belonging to all 5 C. auris clades, with the aim, on the one hand, of comparing the agreement rates and MIC distributions between the methods and, on the other hand, of determining the population WT for each method.
Αριθμός σελίδων
159Σχολή
Σχολή Επιστημών Υγείας & ΠρόνοιαςΑκαδημαϊκό Τμήμα
Τμήμα Βιοϊατρικών ΕπιστημώνΓλώσσα
ΕλληνικάΣυλλογή
Εκτός από όπου επισημαίνεται κάτι διαφορετικό, το τεκμήριο διανέμεται με την ακόλουθη άδεια:
Αναφορά Δημιουργού - Μη Εμπορική Χρήση - Παρόμοια Διανομή 4.0 Διεθνές
Αναφορά Δημιουργού - Μη Εμπορική Χρήση - Παρόμοια Διανομή 4.0 Διεθνές