Μελέτη επιπέδων αντοχής στα αντιβιοτικά και μοριακής τυποποίησης κλινικών στελεχών Escherichia coli

Abstract

Η εξέλιξη της επιστήμης με την ανακάλυψη των αντιβιοτικών συνέβαλε στην πρόληψη και κυρίως στην θεραπεία βακτηριακών λοιμώξεων. Τα αντιβιοτικά είναι απαραίτητα για τον έλεγχο και τη θεραπεία λοιμώξεων του ανθρώπου. Ωστόσο, η αλόγιστη και μη ορθολογική χρήση τους οδήγησε στην αύξηση και στη διασπορά βακτηρίων ανθεκτικών στα αντιβιοτικά. Ως εκ τούτου, η ευεργετική δράση των αντιβιοτικών απειλείται λόγω αυτής της κατάστασης. Το φαινόμενο της αντιμικροβιακής αντοχής δεν περιορίζεται μόνο στο νοσοκομειακό αλλά και στο ευρύτερο περιβάλλον. Ωστόσο, οι χώροι υγειονομικής περίθαλψης μπορούν να θεωρηθούν ως πηγή ανθεκτικών και πολύ-ανθεκτικών βακτηρίων και για αυτό κρίνεται απαραίτητη η συστηματική επιτήρηση, στοχεύοντας στο έλεγχο και τον περιορισμό του φαινομένου. Το βακτήριο Escherichia coli (E. coli) είναι ένα Gram αρνητικό βακτήριο το οποίο αποτελεί συχνή αιτία ουρολοιμώξεων, βακτηριαιμιών αλλά και γαστρεντερίτιδων, τόσο στο νοσοκομειακό χώρο όσο και στη κοινότητα. Η εμφάνιση και η διασπορά ανθεκτικών στελεχών E. coli στο ενδονοσοκομειακό περιβάλλον έχει προκαλέσει μεγάλη ανησυχία στην επιστημονική κοινότητα. Σκοπός της παρούσας διπλωματικής εργασίας αφορούσε τη μελέτη των επιπέδων αντοχής, την ανίχνευση μηχανισμών που προσδίδουν ανθεκτικότητα καθώς και τη μοριακή φυλογενετική τυποποίηση κλινικών στελεχών E.coli. Συνολικά μελετήθηκαν 139 στελέχη που είχαν συλλεχθεί από το Γενικό Νοσοκομείο Λιβαδειάς. Για τη φυλογενετική ταξινόμηση εφαρμόστηκε η μοριακή μέθοδο του Phylogrouping-triplex PCR. Σύμφωνα με τα αποτελέσματα η πλειοψηφία των στελεχών (75/139 ή 54%) εμφάνισε αντοχή σε τουλάχιστον ένα αντιβιοτικό παράγοντα. Σε 8 στελέχη ανιχνεύτηκαν γονίδια αντοχής της ομάδας CTX-M-group 1 ενώ σε 3 στελέχη ήταν ταυτόχρονα θετικά και για το γονίδιο της ομάδας ΤΕΜ-Α. Σύμφωνα με τη φυλογενετική τυποποίηση τους, τα στελέχη κατατάχθηκαν σε 4 φυλογενετικές ομάδες (A, B1, B2 και D), με την ομάδα Β2 να είναι η επικρατέστερη.