Επεξεργασία μεταβολομικών δεδομένων με φασματοσκοπία πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού

Κολάκη, Ευμορφία Άννα

dc.contributor.advisor	Zoumpoulakis, Panagiotis
dc.contributor.author	Κολάκη, Ευμορφία Άννα
dc.date.accessioned	2022-08-31T16:25:50Z
dc.date.available	2022-08-31T16:25:50Z
dc.date.issued	2022-07-19
dc.identifier.uri	https://polynoe.lib.uniwa.gr/xmlui/handle/11400/2814
dc.identifier.uri	http://dx.doi.org/10.26265/polynoe-2654
dc.description.abstract	Η παρούσα διπλωματική έχει ως σκοπό την εφαρμογή της γλώσσας προγραμματισμού R καθώς και μεθόδων πολυμεταβλητής στατιστικής ανάλυσης σε δεδομένα μεταβολομικής από φασματοσκοπία Πυρηνικού Μαγνητικού Συντονισμού (NMR). Στόχος ήταν η αναζήτηση του βέλτιστου τρόπου επεξεργασίας των φασματικών δεδομένων για την περαιτέρω στατιστική ανάλυση. Συγκεκριμένα χρησιμοποιήθηκε μια βάση φασματοσκοπικών δεδομένων που αναφέρονται στο μεταβολικό αποτύπωμα συγκεκριμένης ποικιλίας ντομάτας καθώς και το ελεύθερα διαθέσιμο λογισμικό NMRProcFlow το οποίο αναλύει και επεξεργάζεται φάσματα NMR χωρίς να είναι αναγκαία η γραφή κώδικα. Για την πολυμεταβλητή στατιστική ανάλυση χρησιμοποιήθηκαν μέθοδοι - όπως η PCA, η PLS-DA και η OPLS-DA. Επίσης, ταυτοποιήθηκαν και ποσοτικοποιήθηκαν οι μεταβολίτες των φασμάτων μέσω εφαρμογής αυτοματοιποιημένου αλγορίθμου. Ακολούθησε συγκριτική στατιστική ανάλυση με χρήση των συγκεντρώσεων των μεταβολιτών.	el
dc.format.extent	68	el
dc.language.iso	el	el
dc.publisher	Πανεπιστήμιο Δυτικής Αττικής	el
dc.rights	Αναφορά Δημιουργού - Μη Εμπορική Χρήση - Παρόμοια Διανομή 4.0 Διεθνές	*
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/deed.el	*
dc.subject	Mεταβολομική	el
dc.subject	Μεταβολίτες	el
dc.subject	Στατιστική ανάλυση	el
dc.subject	R	el
dc.subject	Φασματοσκοπία NMR	el
dc.subject	Πολυμεταβλητή στατιστική ανάλυση	el
dc.subject	PCA	el
dc.subject	PLS-DA	el
dc.subject	OPLS-DA	el
dc.title	Επεξεργασία μεταβολομικών δεδομένων με φασματοσκοπία πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού	el
dc.title.alternative	Processing of metabolomic data from nuclear magnetic resonance spectroscopy	el
dc.type	Διπλωματική εργασία	el
dc.contributor.committee	Cavouras, Dionisis
dc.contributor.committee	Matsoukas, Minos-Timotheos
dc.contributor.faculty	Σχολή Μηχανικών	el
dc.contributor.department	Τμήμα Μηχανικών Βιοϊατρικής	el
dc.description.abstracttranslated	The purpose of this thesis is the application of R-programming as well as multivariate statistical analysis on metabolic data derived from Nuclear Magnetic Resonance (NMR) Spectroscopy. The main aim was to find the best way to process the spectral data for further statistical analysis. A spectroscopic data base which is the metabolic fingerprint of a specific species of tomato was used. Also, the freely available software called NMRPRocFLow was utilized which analyzes and processes NMR spectra, without the need to use coding skills. We conducted multivariate statistical analysis by using PCA, PLS-DA and OPL-DA methods. Quantification and identification of metabolites from the NMR spectra of tomatoes has occurred by using a specialized, automated algorithm. Lastly, in order to assess the results, a statistical analysis has been done over the concentration of metabolites.	el

Files in this item

Name:: bme_15049.pdf
Size:: 6.320Mb
Format:: PDF

View/Open

This item appears in the following Collection(s)

Διπλωματικές εργασίες
Διπλωματικές εργασίες τμήματος Μηχανικών Βιοϊατρικής

Show simple item record

Except where otherwise noted, this item's license is described as
Αναφορά Δημιουργού - Μη Εμπορική Χρήση - Παρόμοια Διανομή 4.0 Διεθνές