Εύρεση φυσικών ενώσεων με αντιμικροβιακές ιδιότητες έναντι τροφιμογενών νοσημάτων με υπολογιστικά εργαλεία

Νικολάου, Ιφιγένεια; Μάρκου, Μαρία

dc.contributor.advisor	Κρίτση, Ευτυχία
dc.contributor.author	Νικολάου, Ιφιγένεια
dc.contributor.author	Μάρκου, Μαρία
dc.date.accessioned	2023-03-02T11:43:07Z
dc.date.available	2023-03-02T11:43:07Z
dc.date.issued	2023-02-28
dc.identifier.uri	https://polynoe.lib.uniwa.gr/xmlui/handle/11400/3791
dc.identifier.uri	http://dx.doi.org/10.26265/polynoe-3631
dc.description.abstract	Στα συσκευασμένα τρόφιμα η ανάπτυξη καθώς και η επιβίωση παθογόνων μικροοργανισμών δύναται να προκαλέσει σοβαρές τροφικές ασθένειες διακυβεύοντας την ασφάλεια καθώς και την ποιότητα των τροφίμων. Βακτήρια όπως, Salmonella spp. και Escherichia coli είναι υπεύθυνα για την πρόκληση σοβαρών τροφιμογενών ασθενειών και η αντιμετώπισή τους κρίνεται απαραίτητη. Ορισμένοι από τους συνηθέστερους τρόπους αντιμετώπισης τους είναι η παστερίωση και η χρήση αντιβιοτικών. Λόγω των προβλημάτων που παρουσιάζουν οι παραπάνω μέθοδοι (υποβάθμιση οργανοληπτικών χαρακτηριστικών, αντοχή στα αντιβιοτικά) έχουν αναπτυχθεί νέες τάσεις για την καταπολέμηση τους. Προς αυτή την κατεύθυνση, τα τελευταία χρόνια καταβάλλονται αξιόλογες προσπάθειες για την εύρεση νέων ενώσεων που δρουν ως αντιμικροβιακά συστατικά τροφίμων, με τις φυσικές ενώσεις να κατέχουν εξέχουσα θέση. Σκοπός της παρούσας πτυχιακής εργασίας είναι η εύρεση φυσικών ενώσεων με αντιμικροβιακές ιδιότητες έναντι του ενζύμου Τοποϊσομεράση IV του παθογόνου βακτηρίου Escherichia coli, με εφαρμογή Υπολογιστικών Τεχνικών Εικονικής Σάρωσης (Virtual Screening Techniques). Συγκεκριμένα, οι φυσικές ενώσεις της βιβλιοθήκης «Specs» (https://www.specs.net/) υποβλήθηκαν σε πειράματα Μοριακής Πρόσδεσης (Molecular Docking) για τη μελέτη της ικανότητας πρόσδεσης τους στο ένζυμο Τοποϊσομεράση IV του παθογόνου βακτηρίου Escherichia coli. Η αξιολόγηση των αποτελεσμάτων και η τελική επιλογή των ενώσεων βασίστηκε στα ακόλουθα κριτήρια:  Σχηματισμός αλληλεπιδράσεων μεταξύ των εξεταζόμενων ενώσεων και των κρίσιμων για την πρόσδεση αμινοξέων.  Ικανότητα πρόσδεσης των εξεταζόμενων φυσικών ενώσεων (Glide-score). Τέλος, από την αξιολόγηση των αποτελεσμάτων της Μοριακής Πρόσδεσης προέκυψαν έξι ενώσεις, οι οποίες δύναται να αγοραστούν μελλοντικά και να πραγματοποιηθεί in vitro βιολογική τους αποτίμηση ως αναστολείς του εξεταζόμενου ενζύμου.	el
dc.format.extent	72	el
dc.language.iso	el	el
dc.publisher	Πανεπιστήμιο Δυτικής Αττικής	el
dc.rights	Αναφορά Δημιουργού - Μη Εμπορική Χρήση - Παρόμοια Διανομή 4.0 Διεθνές	*
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/deed.el	*
dc.subject	Παθογόνα βακτήρια	el
dc.subject	Τροφιμογενή νοσήματα	el
dc.subject	Τοποϊσομεράση IV	el
dc.subject	Φυσικές ενώσεις	el
dc.subject	Τεχνικές εικονικής σάρωσης	el
dc.subject	Μοριακή πρόσδεση	el
dc.title	Εύρεση φυσικών ενώσεων με αντιμικροβιακές ιδιότητες έναντι τροφιμογενών νοσημάτων με υπολογιστικά εργαλεία	el
dc.title.alternative	Discovery of natural compounds with antimicrobial properties against food diseases by applying computational tools	el
dc.type	Πτυχιακή εργασία	el
dc.contributor.committee	Zoumpoulakis, Panagiotis
dc.contributor.committee	Κοντελές, Σπυρίδων
dc.contributor.faculty	Σχολή Επιστημών Τροφίμων	el
dc.contributor.department	Τμήμα Επιστήμης και Τεχνολογίας Τροφίμων	el
dc.description.abstracttranslated	In packaged foods, the growth and survival of pathogenic microorganisms can cause serious foodborne diseases, compromising the safety and quality of the food. Bacteria such as, Salmonella spp. and Escherichia coli are responsible for serious foodborne illnesses and their treatment is considered essential. Certain common ways for their treatment are pasteurization and the use of antibiotics. Due to the problems presented by the above methods (degradation of organoleptic characteristics, resistance to antibiotics) new trends have been developed to overcome them. Towards this direction, in recent years considerable efforts have been made to discover novel compounds that act as antimicrobial food ingredients, with natural compounds occupying a prominent position. The aim of the present thesis is the discovery of natural compounds with antimicrobial properties against the Topoisomerase IV enzyme of the pathogenic bacterium Escherichia coli, by applying Virtual Screening Techniques. Specifically, the natural compounds contained to the "Specs" library (https://www.specs.net/) were subjected to Molecular Docking study, aiming to evaluate their bind affinity to the Topoisomerase IV enzyme of the pathogenic bacterium Escherichia coli. The results assessment and the final selection of compounds were based on the following criteria:  Interactions between the tested compounds and the amino acids crucial for the binding.  Predicted binding affinity of the examined natural compounds (Glide-score). Finally, the Molecular Docking results evaluation indicated six compounds as the most promising, which can be purchased in the future and carried out in vitro assays to validate their activity as inhibitors of the examined enzyme.	el

Files in this item

Name:: Πτυχιακή_Εργασία_ΜΜάρκου_ΙΝικο ...
Size:: 3.987Mb
Format:: PDF
Description:: Πτυχιακή Εργασία

View/Open

This item appears in the following Collection(s)

Πτυχιακές εργασίες
Πτυχιακές εργασίες τμήματος Επιστήμης και Τεχνολογίας Τροφίμων

Show simple item record

Except where otherwise noted, this item's license is described as
Αναφορά Δημιουργού - Μη Εμπορική Χρήση - Παρόμοια Διανομή 4.0 Διεθνές