Διαφορετικοί ορότυποι E.coli σε τρόφιμα και μέθοδοι ανίχνευσής τους

Abstract

Θέμα της παρούσας πτυχιακής εργασίας είναι οι διαφορετικοί ορότυποι των βακτηρίων Escherichia Coli στα τρόφιμα και οι μέθοδοι ανίχνευσής τους. Φέρει 4 ομάδες αντιγόνων: τα Ο - σωματικά αντιγόνα, τα Η- αντιγόνα μαστιγίου, τα Κ-περιβληματικά αντιγόνα, τα F- αντιγόνα. Η διάκριση σε ορότυπους του E.coli είναι μία πολύπλοκη διαδικασία που ξεκινάει από το αντιγόνο Ο, το οποίο καθορίζει την ορομάδα και τα αντιγόνα Η καθορίζουν τους διαφορετικούς ορότυπους. Πρόκειται για έναν δυνητικά παθογόνο μικροοργανισμό που φυσιολογικά αποικίζει τον γαστρεντερικό σωλήνα του ανθρώπου, αλλά και άλλων ζώων όπως τα μηρυκαστικά και τα ερπετά. Ορισμένα στελέχη E.coli είναι παθογόνα και ο άνθρωπος μπορεί να μολυνθεί από αυτά είτε από την κατανάλωση μολυσμένων τροφίμων ή νερού, μέσω επαφής με τα περιττώματα μολυσμένων ζώων ή ανθρώπων. Τα συμπτώματα που μπορεί να παρουσιάσει ένας άνθρωπος που έχει μολυνθεί από παθογόνα στελέχη Ε.coli είναι ποικίλα και κυμαινόμενης σοβαρότητας. Έτσι, μπορεί να εμφανίσει διάρροιες ή ακόμη και εντεροαιμορραγία, λοιμώξεις του ουροποιητικού συστήματος, όπως και μηνιγγίτιδα, πνευμονία ή ακόμη και σηψαιμία. Παραδοσιακά η ανίχνευση και η ταυτοποίηση των οροτύπων E.coli γίνεται με καλλιέργεια βιολογικών υγρών ασθενών ατόμων ή μολυσμένων τροφίμων, αλλά και πιο πρόσφατα με τη βοήθεια φαινοτυπικών μεθόδων ανάλυσης, όπως είναι η ταυτοποίηση με βακηριοφάγους ή η τεχνική MALDI – TOF MS, ανοσολογικών μεθόδων ανάλυσης, όπως είναι η ELISA ή η δοκιμασία ανοσομαγνητικού διαχωρισμού, μοριακών μεθόδων ανάλυσης, όπως ο πολυτοπικός προσδιορισμός αλληλουχίας (MLST), το πολλαπλό PCR ή η υψηλής απόδοσης PCR σε πραγματικό χρόνο. Μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθούν οπτικοί, πιεζοηλεκτρικοί ή ηλεκτροχημικοί βιοαισθητήρες.